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Sebastian Höpfl

M. Sc.

Wissenschaftlicher Mitarbeiter
Institut für Stochastik und Anwendungen
Mathematische Modellierung und Simulation zellulärer Systeme

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Fachgebiet

Systembiologie und der Umgang mit parametrisierten Modellen. Im Moment beschäftige ich mich mit der Datenintegration in Multiskalen-Modelle durch statistische Methoden und Unsicherheitsanalyse in der DFG Forschungsgruppe QuaLiPerF.

Publikationsliste:
  1. Sebastian, H., Jürgen, P., & Nicole, R. (2023). Bayesian estimation reveals that reproducible models in Systems Biology get more citations. Scientific reports. https://doi.org/10.1038/s41598-023-29340-2
  2. Wagner, V., Höpfl, S., Klingel, V., Pop, M. C., & Radde, N. E. (2022). An inverse transformation algorithm to infer parameter distributions from population snapshot data. IFAC-PapersOnLine, 55(23), Article 23. https://doi.org/10.1016/j.ifacol.2023.01.020
  3. Albadry, M., Höpfl, S., Ehteshamzad, N., König, M., Böttcher, M., Neumann, J., Lupp, A., Dirsch, O., Radde, N., Christ, B., Christ, M., Schwen, L. O., Laue, H., Klopfleisch, R., & Dahmen, U. (2022). Periportal steatosis in mice affects distinct parameters of pericentral drug metabolism. Scientific Reports, 12(1), Article 1. https://doi.org/10.1038/s41598-022-26483-6
  4. Christ, B., Collatz, M., Dahmen, U., Herrmann, K.-H., Höpfl, S., König, M., Lambers, L., Marz, M., Meyer, D., Radde, N., Reichenbach, J. R., Ricken, T., & Tautenhahn, H.-M. (2021). Hepatectomy-Induced Alterations in Hepatic Perfusion and Function - Toward Multi-Scale Computational Modeling for a Better Prediction of Post-hepatectomy Liver Function. Frontiers in Physiology, 12. https://doi.org/10.3389/fphys.2021.733868
  5. Höpfl, S., Tautenhahn, H.-M., Wagner, V., & Radde, N. E. (2024). Marginal Percentile Intervals in Bayesian Inference are Overconfident. IFAC-PapersOnLine.
  6. Armistead, J., Höpfl, S., Goldhausen, P., Müller-Hartmann, A., Fahle, E., Hatzold, J., Franzen, R., Brodesser, S., Radde, N. E., & Hammerschmidt, M. (2024). A sphingolipid rheostat controls apoptosis versus apical cell extrusion as alternative tumour-suppressive mechanisms. Cell Death & Disease, 15(10), Article 10. https://doi.org/10.1038/s41419-024-07134-2
  7. Höpfl, S., Albadry, M., Dahmen, U., Herrmann, K.-H., Kindler, E. M., König, M., Reichenbach, J. R., Tautenhahn, H.-M., Wei, W., Zhao, W.-T., & Radde, N. E. (2024). Bayesian modelling of time series data (BayModTS)—a FAIR workflow to process sparse and highly variable data. Bioinformatics, 40(5), Article 5. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btae312
Seit 04/2021 Wissenschaftlicher Mitarbeiter am Institut für Systemtheorie and Regelungstechnik  Universität Stuttgart, Deutschland.
11/2018 - 03/2021

Masterstudium der Technischen Biologie an der Universität Stuttgart.

Spezialisierung:

  • Pharmazeutische Biotechnologie (Molekulare Tumorzellbiologie und Bioproduktaufarbeitung)
  • Computational Biology (Dynamische Modellierung und Protein Design)

Masterarbeit: "Implementierung und Simulation von DLC1 im TGF-b induzierten
Epithelialen-Mesenchymalen-Übergang (EMT)." Am Institut für Systemtheorie and Regelungstechnik in der Systembiologie Gruppe von Nicole Radde.
10/2015 - 10/2018

Bachelorstudium der Technischen Biologie an der Universität Stuttgart.

Bachelorarbeit: "Nachweis von in vivo RNA:RNA Interaktionen– Untersuchung und Optimierung der experimentellen Schlüsselschritte." Am Institut für Bioverfahrenstechnik in der Gruppe Computational Biology, Bioinformatics and RNA Biology von Björn Voß.
2017

Industriepraktikum bei der Autoimmun Diagnostika GmbH in Straßberg, Germany.

Thema: "Erarbeitung einer statistischen Methode zur Qualitätsüberwachung von Antigen-Chargen in der EliSpot-Diagnostik."
06/2015

Abitur am Biotechnologischen Gymnasium der HWS Albstadt.
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